สมัยนั้นสยามไม่ได้เป็น 1 เดียว มีหลายหัวเมือง แต่ยกอยุธยาเป็นใหญ่ พิษณุโลกขัดแย้งกับอยุธยาเพราะไม่ส่งกองทัพมาช่วยรบพม่า พิษณุโลกเลยเข้ากับพม่ามาตีกรุงศรีแล้วปกครองอยุธยาแทนพม่า ผลัดราชวงศ์จากสุพรรณภูมิเป็นสุโขทัย
พระนเรศวรกู้เอกราชจากพม่า แล้วปกครองทั้งพิษณุโลกและอยุธยาในฐานะราชวงศ์สุพรรณภูมิ พระองค์มีเชื้อพิษณุโลกทางพ่อ และอยุธยาทางแม่ จะถือว่ามีสิทธิปกครองทั้ง 2 เมืองก็ได้
ควรเข้าใจอย่างนึงว่าการแบ่งราชวงศ์เป็นอู่ทอง สุพรรณภูมิ สุโขทัย เป็นคนสมัยใหม่ตั้ง สมัยนั้นไม่แน่ว่าจะแบ่งแบบนี้